Zawartość
Peptydy to fragmenty krótkich polimerów zbudowanych z aminokwasów. Każdy peptyd ma określoną sekwencję aminokwasów oznaczoną trzyliterowym kodem lub tylko jednym; na przykład aminokwas alanina jest określany skrótem „Ala” lub „A”. Ilość peptydów w roztworze zależy od jego kwasowości. Punkt izoelektryczny (pI) odnosi się do wartości kwasowości roztworu, w którym cząsteczka peptydu ma ładunek netto równy zero. Rozpuszczalność peptydu jest minimalna w punkcie izoelektrycznym. Użyj dostępnych serwerów internetowych, aby obliczyć wartość pI dla sekwencji aminokwasowej peptydu.
Krok 1
Sekwencjonuj peptyd przy użyciu kodu jednoliterowego. Na przykład, jeśli peptyd ma sekwencję aminokwasów Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanina - Seryna - Kwas glutaminowy - Leucyna - Prolina), to sekwencją jednoliterową będzie „ASELP”. W razie potrzeby zapoznaj się z tabelą konwersji z jednej na trzy litery, znajdującą się w sekcji Zasoby.
Krok 2
Użyj dowolnej przeglądarki, takiej jak Internet Explorer lub Firefox, aby wejść na serwer, który oblicza punkt izoelektryczny peptydu (pI); zobacz Zasoby.
Krok 3
Wpisz jednoliterową sekwencję peptydu - w naszym przykładzie „ASELP” - w polu i kliknij „Oblicz”.
Krok 4
Odczytaj wartość punktu izoelektrycznego (pI) podaną w wierszu „Teoretyczne pI / Mw” (teoretyczne pl). W naszym przykładzie pI wynosi 4,00. Należy zauważyć, że serwer oblicza również masę cząsteczkową (Mw) peptydu.