Zawartość
Związki chemiczne bromek cetylotrimetyloamoniowy, bromek heksadecylotrimetyloamoniowy, bromek palmitylotrimetyloamoniowy i bromek cetrimonium są również znane przez CTAB. Substancja chemiczna jest stosowana jako substancja utrzymująca pH w sekwencyjnym genomie DNA, zwłaszcza w roślinach.
Frezowanie rozbija ściany komórkowe roślin do ekstrakcji DNA (Jason Reed / Ryan McVay / Digital Vision / Getty Images)
Formuła CTAB
Ilości formuł różnych chemikaliów CTAB różnią się w zależności od laboratorium. Jednak wszystkie składniki obejmują 1 M Tris HCl pH 8,0, 0,5 M EDTA, 5 M NaCl i H2O (czasami dwukrotnie destylowany). W przypadku składnika CTAB niektóre laboratoria stosują bromek cetylotrimetyloamoniowy i inne bromek heksadecylotrimetyloamoniowy.
Przygotowanie tkanek roślinnych
Przygotowanie tkanki roślinnej może się różnić w zależności od materiału. Ściany i błony komórkowe muszą zostać zerwane, aby uzyskać dostęp do materiału jądrowego bez jakiejkolwiek degradacji. Normalnie, podczas mielenia, materiał roślinny z ciekłym azotem umożliwia dostęp do DNA, zachowując szkodliwe enzymy komórkowe i nieaktywne chemikalia.
Zawiesina i wirowanie
Zmiażdżoną tkankę umieszcza się na ostrzu CTAB i wkłada do miski z bieżącą wodą. Następnie miesza się go z chloroformem i odwirowuje w celu oddzielenia rozpuszczalnych białek i innych materiałów. DNA wytrąca się następnie z fazy wodnej i ostrożnie przemywa w celu usunięcia zanieczyszczających soli. Oczyszczony DNA jest następnie pobierany i przechowywany na szkiełku TE lub sterylnej wodzie destylowanej.